为协助产业发展，调和区域法规以及提升行政作业效率与审查透明化，行政院卫生署参考先进国家药物食品管理组织体例，将原行政院卫生署「食品卫生处」、「药政处」、「药物食品检验局」、「管制药品管理局」等单位将完成整并，成立「食品药物管理局（TFDA）」.于102/07/23改为卫生福利部食品药物管理署。

 食品药物管理署职掌将包括：

• 食品、西药、管制药品、医疗器材、化妆品(以下简称食品药物化妆品)管理、计划及法规之研拟。
• 食品药物化妆品之查验登记、审核、给证及备查。
• 应实施人体试验之药物，其人体试验之审查与监督。
• 食品药物化妆品业者之生产流程管理、进口检(查)验、流通、稽查、查核及辅导。
• 食品药物化妆品之检验、研究、实验室认证、风险评估及风险管理。
• 食品药物化妆品之安全监视、危害事件调查及处理。
• 管制药品之稽核、通报、预警、滥用防制及第一级、第二级管制药品之制造、输出入及销售。
• 国民营养之标准拟定、监测、膳食调查、营养增进。
• 食品药物化妆品消费者保护措施之推动。
• 食品药物化妆品事务之国际合作与交流。
• 食品药物化妆品事务之境外管理作业。
• 药师业务之管理事项。
• 其他西药药事业务及食品药物化妆品有关之管理事项。